Le Cerema est l'établissement de référence dans les domaines de l'expertise et de l'ingénierie publique pour accompagner les territoires dans leurs missions d'adaptation aux changements climatiques. Il assiste l'État, les collectivités territoriales et les entreprises pour les conduire vers une stratégie d'aménagement durable et des mobilités adaptées aux enjeux écologiques. Le Cerema offre des solutions adaptées et uniques selon les territoires.

Centre de ressources de référence, il éclaire les choix des décideurs publics et les accompagne dans la mise en oeuvre de leurs projets de développement. Présent sur l'ensemble du territoire national avec plus de 2 600 agents, le Cerema a engagé un plan ambitieux de transformation afin de devenir l'opérateur de référence des collectivités locales et des entreprises. Cette mutation se traduit par une accentuation de la valorisation de ses expertises.La direction territoriale Centre-Est représente le Cerema dans les régions Auvergne-Rhône-Alpes et Bourgogne-Franche-Comté.
Le département «Transitions territoriales», compte aujourd'hui 50 agents répartis en 3 groupes  : Appuis Territoires Transitions, Bâtiment, Environnement, et une mission Données et Géomatique.

Il a vocation à accompagner les territoires pour une mise en mouvement vers la transition écologique, énergétique et climatique en contribuant au projet des territoires par la prise en compte et l?intégration de ses différent(e)s caractéristiques et leviers. Ses compétences sont celles de « l'ensemblier-expert », souvent en posture d'AMO, en capacité d'appuyer les collectivités et l'État dans les processus de projets, expérimentations, innovations, évaluations au moyen d'outils et animations adaptées.