La Direction technique Risques, Eaux et Mer, qui compte 168 postes sur 4 sites, assure des missions d'expertise, de diffusion des connaissances et de recherche dans les domaines de l'eau, des risques, du littoral, des énergies marines renouvelables, des transports maritimes et fluviaux et de l'innovation et du numérique. Au sein du Cerema, elle porte l'expertise technique, pilote la production et les offres de service, assure le suivi des grands comptes nationaux.
Le département « Prototypes et projets numériques » a pour missions l'étude, la réalisation, la valorisation et la maintenance de prototypes pour le Cerema. Il participe à l'animation du secteur TSNI, de développer des outils numériques métiers.
Le groupe « Prospective et pilotage prototypes» pilote l?activité prototypes, optimise son développement, et son innovation technologique'

Le Cerema est l'établissement de référence dans les domaines de l'expertise et de l?ingénierie publique pour accompagner les territoires dans leurs missions d'adaptation aux changements climatiques.  Il assiste l'État, les collectivités territoriales et les entreprises pour les conduire vers une stratégie d'aménagement durable et des mobilités adaptées aux enjeux écologiques. Le Cerema offre des solutions adaptées et uniques selon les territoires.

Centre de ressources de référence, il éclaire les choix des décideurs publics et les accompagne dans la mise en oeuvre de leurs projets de développement. Présent sur l'ensemble du territoire national avec plus de 2600 agents, le Cerema a engagé un plan ambitieux de transformation afin de devenir l?opérateur de référence des collectivités locales et des entreprises. Cette mutation se traduit par une accentuation de la valorisation de ses expertises. Pour cela, il a fortement renouvelé son organisation et son mode de fonctionnement. Parallèlement, le Cerema s'est recentré sur son coeur de métier et oriente ses activités et prestations vers les besoins réels de ses partenaires.