Rattaché au secrétariat général du ministère de la transition écologique et de la cohésion des territoires, le SHFDS a pour vocation principale d'assister le HFDS dans l'exercice des responsabilités prévues par le décret n°2007-207 du 19/02/2017.

En son sein, le département de la résilience et de la gestion de crises veille à organiser la préparation technique ministérielle de réponse aux crises en renforçant le dispositif de veille opérationnelle et d'alerte, en poursuivant et en entretenant la professionnalisation des personnels appelés à gérer la chaîne opérationnelle gouvernementale. Il mène en liaison avec les directions générales concernées les activités de planification pour la protection contre le terrorisme et contre les risques civils.

Le bureau résilience et protection des entités critiques porte la politique nationale des entités critiques vers les opérateurs d'importance vitale, il en organise et pilote les inspections et diffuse à l'ensemble des autres opérateurs les éléments facilitateurs pour la mise en place d'une politique de sûreté. Par ailleurs il est également le point focal de la procédure Vigipirate pour le ministère et il assure le secrétariat permanent de la CISDI.